Language:

  • Greek
  • English (United Kingdom)

ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΦΥΤΩΝ & ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ

bio_lab_futperiv

         Επιλογές
1. Γενικές Πληροφορίες 6. Διατριβές
2. Ερευνητικά Ενδιαφέροντα i. Ερευνητικός Εξοπλισμός
3. Προσωπικό ii. Παροχή Υπηρεσιών
4. Ερευνητικά προγράμματα 7. Φωτογραφικό Υλικό
5. Δημοσιεύσεις 8.
 Συνδέσεις
    9. Επικοινωνία
       

 

1. Γενικές Πληροφορίες:

Το Εργαστήριο Βιοτεχνολογίας Φυτών & Περιβάλλοντος ιδρύθηκε με το ΦΕΚ 511/3.4.2015. Η ερευνητική ομάδα Βιοτεχνολογίας Φυτών και Περιβάλλοντος ασχολείται με την μελέτη των αλληλεπιδράσεων των φυτών με τους μικροοργανισμούς και το περιβάλλον και τις βιοτεχνολογικές εφαρμογές φυτών και μικροοργανισμών σε επίπεδο (α) βελτιωμένων παραγωγικών διαδικασιών, (β) παραγωγής βιοδραστικών μορίων και (γ) διεργασιών προστασίας του περιβάλλοντος. Η ερευνητική ομάδα χρησιμοποιεί για τις δραστηριότητες της ένα πλήρως εξοπλισμένο εργαστήριο έκτασης  65 m2  που βρίσκεται στο κεντρικό κτήριο του Τμήματος, δυο δωμάτια κατάλληλα διαμορφωμένα για την ανάπτυξη φυτών και ένα κατάλληλα διαμορφωμένο χώρο στο υπόγειο του κεντρικού κτηρίου του Τμήματος για την επεξεργασία εδάφους και την πραγματοποίηση πειραμάτων με γεωργικά φάρμακα.

2. Ερευνητικά Ενδιαφέροντα:

  • Βιοτεχνολογία Φυτών- Δευτερογενής μεταβολισμός φυτών: Γενετική και μοριακή ανάλυση βιοσυνθετικών μονοπατιών τερπενοειδών και γλυκοσινολικών οξέων, τροποποίηση της σύνθεσης τους σε φυτά-μοντέλα ψυχανθών και μελέτη της επίδρασής τους στη φυσιολογία  και άμυνα του φυτού, επίδραση περιβαλλοντικών παραγόντων στη ρύθμιση βιοσυνθετικών γονιδίων και στα μεταβολικά πρότυπα
  • Αλληλεπίδραση Φυτών – Μικροοργανισμών: Δενδρόμορφοι μυκορριζικοί μύκητες: οικολογία και λειτουργικότητα, Μύκητες με επισχετική δράση κατά εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων, μικροοργανισμοί της ριζόσφαιρας (τριμερείς αλληλεπιδράσεις φυτών –μικροοργανισμών)
  • Περιβαλλοντική Μικροβιολογία: Επιταχυνόμενη μικροβιακή διάσπαση γεωργικών φαρμάκων, απομόνωση βακτηρίων που αποδομούν και χαρακτηρισμός των καταβολικών γονιδίων / ένζυμων, βιολογική αποδόμηση - αποτοξικοποίηση υγρών αποβλήτων αγροτικής προέλευσης
  • Μικροβιακή Οικολογία: Επιδράσεις αγροτικών πρακτικών  στην δομή και λειτουργία της μικροβιακής κοινότητας
  • Περιβαλλοντική Ρύπανση: Τύχη και συμπεριφορά γεωργικών φαρμάκων στο περιβάλλον.
  • Βιολογικές δράσεις φυτικών μεταβολιτών: Διερεύνηση των μοριακών μηχανισμών της αντικαρκινικής δράσης σε ανθρώπινα κύτταρα
  • Μοριακή διάγνωση σε ευρεία κλίμακα ιστών από ανθρώπινους, ζωϊκούς και φυτικούς οργανισμούς και σε περιβαλλοντικά δείγματα

3. Προσωπικό:

Μέλη ΔΕΠ

  • Αναπληρώτρια Καθηγήτρια Βιοτεχνολογίας Φυτών Καλλιόπη Παπαδοπούλου
  • Αναπληρωτής Καθηγητής Περιβαλλοντικής Μικροβιολογίας και Βιοτεχνολογίας Δημήτριος Καρπούζας
  • Επίκουρος Καθηγήτρια Βιοχημικής Φαρμακολογίας Καλλιόπη Λιαδάκη

Μεταδιδάκτορες

  • Δρ. Κωνσταντίνος Γκαραγκούνης
  • Δρ. Μαρία Τουρνά
  • Δρ. Ευαγγελία Παπαδοπούλου
  • Dr Chiara Perruchon

Υποψήφιοι Διδάκτορες

  • Παναγιώτης Καράς
  • Κωνσταντίνα Ρουσίδου
  • Βασιλική Σκιαδά
  • Αθανασία Κατσούλα
  • Παναγιώτα Μάρκου
  • Παπαζλατάνη Χριστίνα
  • Παπαντωνίου Δήμητρα
     

Σήμερα το εργαστήριο φιλοξενεί και δύο ερευνητές από την Χιλή και την Γαλλία που εργάζονται σε διαφορετικά προγράμματα για διάστημα 6 ως 11 μήνες:  Marco Campos και Celine Bagueli.
     
icon fileΠΡΟΣΩΠΙΚΟ ΕΡΓΑΣΤΗΡΙΟΥ ΒΙΟΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ ΦΥΤΩΝ ΚΑΙ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ.

4. Ερευνητικά Προγράμματα:

  1. Ερευνητικό Πρόγραμμα ΔΕΣΜΗ, Τίτλος: Μελέτη της περιεκτικότητας των φυτών Brassica σε γλυκοσινολικά οξέα και η χρήση τους για βιοαπολύμανση του εδάφους, Φορέας Χρηματοδότησης: Ινστιτούτο Προώθησης της Έρευνας Κύπρου, Διάρκεια: 1/1/2007 – 31/12/2009. Επιστημονικός Υπεύθυνος: Κ. Παπαδοπούλου.
  2.  Marie Curie Reintegration Grand "ECOMYCORRHIZA - The effects of agronomic practices conducive to organic agriculture on the diversity and function of arbuscular mycorrhizal fungi", Benefited Fellow: Δρ. Ι. Υψηλάντης, Φορέας Χρηματοδότησης European Commission FP7 Proposal Number 204792, Διάρκεια 1/10/2007 – 30/9/2010. Επιστημονικός Υπεύθυνος: Δημήτριος Καρπούζας 
  3.  Eρευνητικό Πρόγραμμα ΔΕΣΜΗ, Τίτλος: Αξιολόγηση των βιοκλινών για την απορρύπανση υγρών αποβλήτων γεωργικής προέλευσης: BIOBEDS, Φορέας Χρηματοδότησης: Ινστιτούτο Προώθησης της Έρευνας Κύπρου, Διάρκεια: 1/12/08-30/11/2010 Επιστημονικός Υπεύθυνος: Δημήτριος Καρπούζας 
  4. Χρηματοδότηση ερευνητικών δραστηριοτήτων, Επιτροπή Ερευνών Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, Τίτλος: Απομόνωση, ταυτοποίηση και χαρακτηρισμός βακτηρίων που διασπούν οργανοφωσφορικά και καρβαμιδικά γεωργικά φάρμακα. Διάρκεια: 1/10/2009 – 30/9/2011. Επιστημονικός Υπεύθυνος: Δημήτριος Καρπούζας
  5. Κουπόνια Καινοτομίας, Αξιολόγηση δενδρόμορφων μυκορριζικών μυκήτων ως βιοτεχνολογικά εργαλεία για την βελτιστοποίηση της αφομοίωσης Ρ από τα φυτά. Φορέας Χρηματοδότησης: ΓΓΕΤ. Διάρκεια 18/4/2011 – 18/8/2011. ΕπιστημονικόςΥπεύθυνος και Συντονιστής: ΔημήτριοςΚαρπούζας
  6. SEE.ERA-NETplus, Development and implementation of innovative tools to estimate the ecotoxicological impact of low dose pesticide application in agriculture on soil functional microbial diversity (Acronym: ECOFUN-MICROBIODIV). Φορέας Χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκή Κοινότητα, Διάρκεια: 1/11/2010-30/9/12, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Δημήτριος Καρπούζας, Συντονιστής: INRA, Dijon, France. Website: http://www4.inra.fr/ecofun_microbiodiv_eng/
  7. Πρόγραμμα ΘΑΛΗΣ, Contribution of Mycorrhizae to the sustainability of marginal Mediterranean ecosystems – development of mycorrhizal inocula (Acronym: SALTY-MYC). Φορέας Χρηματοδότησης: ΓΓΕΤ. Διάρκεια: 1/2/2012 – 31/6/2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Δημήτριος Καρπούζας, Συντονιστής: Γεωπονικό Πανεπιστήμιο Αθηνών.
  8.   CARIPLO project, Synthetic and Natural Agrochemical compounds: ecological impacts on the soil ecosystem and effects on plant production (Acronym: SNAC). Φορέας Χρηματοδότησης: CARIPLO Foundation,. Διάρκεια: 1/2012 – 12/2014, Εξωτερικός Συνεργάτης: Δ. Καρπούζας, Συντονιστής: Universita Cattolica del Sacro Cuore, Italy.
  9. Industry-Academia Partnership Project (IAPP) Marie Curie project, Pesticides – Felicity or curse for the soil microbes (Acronym: LOVE-TO-HATE). Φορέας Χρηματοδότησης: 7ο Κοινοτικό Πλαίσιο Στήριξης, Ευρωπαϊκή Κοινότητα, Διάρκεια: 1/1/2013 – 31/12/2016, Επιστημονικής Υπεύθυνος ΠΘ και Συντονιστής: Δημήτριος Καρπούζας, Website: http://lovetohate.bio.uth.gr
  10. A survey of the degradation of the soil insecticide fipronil, fosthiazate, chlorpryifos and ethroprophos in potato cultivation areas in Greece. Φορέας Χρηματοδότησης: Ιδιωτική Εταιρεία, Διάρκεια: 1/4/2013-31/5/2014, Επιστημονικός Υπεύθυνος και Συντονιστής: Δημήτριος Καρπούζας
  11. Χρηματοδότηση ερευνητικών δραστηριοτήτων, Επιτροπή Ερευνών Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, Τίτλος: Μελέτη μοριακών μηχανισμών ανθεκτικότητας καρκινικών κυττάρων σε χημειοθεραπευτικούς παράγοντες χρησιμοποιώντας καρκινικές σειρές σε κυτταροκαλλιέργειες. Χρονική Διάρκεια: 2008-2009. Επιστημονικός Υπεύθυνος: Καλλιόπη Λιαδάκη
  12. Πρόγραμμα ΘΑΛΗΣ, Μηχανισμοί μεταγωγής σήματος και γονιδιακής έκφρασης σε ηπατοκαρκίνωμα. Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Παιδείας, Ελλάδα, Χρονική Διάρκεια: 2011-2014, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Καλλιόπη Λιαδάκη, Συντονιστής: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης.
  13. Ενίσχυση Νέων και Μικρομεσαίων Επιχειρήσεων, Απομόνωση ντόπιων δενδρόμορφων μυκορριζικών μυκήτων και ανάπτυξη μυκορριζικών εμβολίων για εμβολιασμό ριζόσφαιρας και παραγωγή εδαφοβελτιωτικών προϊόντων. Φορέας Χρηματοδότησης: ΓΓΕΤ, Διάρκεια: 1/1/2013-31/12/2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Κ. Παπαδοπούλου Συντονιστής: ΦΥΤΟΘΡΕΠΤΙΚΗ Α.Ε.
  14.  Δράσεις Στοχευμένης Έρευνας, ΒΙΟΚΛΙΝΕΣ: Περιορίζοντας τη σημειακή ρύπανση των φυσικών πόρων της Θεσσαλίας από τα υγρά απόβλητα των συσκευαστηρίων φρούτων. Φορέας Χρηματοδότησης: Επιτροπή Ερευνών Πανεπιστημίου Θεσσαλίας, Διάρκεια: 1/6/2013-31/5/2015, (Επιστημονικός Υπεύθυνος)
  15. Μελέτη της δράσης ενός νέου και υπό αξιολόγηση καπνιστικού εδάφους έναντι επιλεγμένων εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων με την χρήση μοριακών προσεγγίσεων. Φορέας Χρηματοδότησης: Ιδιωτική Εταιρεία, Διάρκεια: 1/8/2013- 31/3/2014. Επιστημονικός Υπεύθυνος και Συντονιστής: Δημήτριος Καρπούζας
  16. ΑΡΙΣΤΕΙΑ ΙΙ, The microbial detoxification of pesticides from the fruit-packaging industry: using omics in bioremediation (BIOREMEDIAT-OMICS). Φορέας Χρηματοδότησης: ΓΓΕΤ, Διάρκεια: 1/2/2014-31/7/2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος και Συντονιστής: Δημήτριος Καρπούζας Website: http://bioremediatomics.bio.uth.gr
  17. IKY-DAAD project: Do we isolate via in vitro enrichment cultures the right pesticide-degrading bacteria? Mechanisms involved and web-food C transfer. Φορέας Χρηματοδότησης: ΙΚΥ, Συνεργασία με το Ινστιτούτο UFZ-Leipzig (Dr A. Chatzinotas), Διάρκεια: 1/1/2014-31/12/2015,  ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςΠΘ: ΔημήτριοςΚαρπούζας
  18. Υποστήριξη Μεταδιδακτόρων,  Τίτλος: FRUIT-OMICS Physiological, biochemical and molecular characterization of nitric oxide and ozone application in the postharvest physiology of kiwifruits, Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Παιδείας, Διάρκεια: 2011-2013, ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςκαιΣυντονιστής: Κ. Παπαδοπούλου
  19.  Πρόγραμμα ΗΡΑΚΛΕΙΤΟΣ, Τίτλος: Genome organization and functional analysis of biosynthetic genes and metabolic  diversity of triterpenoids in legumes, Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Παιδείας, Χρονική Διάρκεια: 2010-2013, ΕπιστημονικόςΥπεύθυνοςκαιΣυντονιστής: Κ. Παπαδοπούλου
  20. Πρόγραμμα ΘΑΛΗΣ, Τίτλος: Ozone application for improving post harvest handling of edible horticultural products. Φορέας Χρηματοδότησης: Υπουργείο Παιδείας, Ελλάδα, Χρονική Διάρκεια: 2011-2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Κ. Παπαδοπούλου, Συντονιστής: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης,
  21. FP7 European Projects KBBE, Title: Triterpenoid For Commercialization, A pipeline for the discovery, sustainable production and commercial utilization of known and novel high-value triterpenes with new or superior biological activities (TRIFORC) Χρονική Διάρκεια: 1/1/2014 - 31/12/2017, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Κ. Παπαδοπούλου
  22. ΑΡΙΣΤΕΙΑ II, Τίτλος: Essential-oil mediated plant-microbe interactions in the Mediterranean environment: in search of a role and novel applications (ESEPIMENT), Φορέας Χρημαδότησης: ΓΓΕΤ, Ελλάδα, Χρονική Διάρκεια 2014-2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Δ. Καρπούζας, Συντονιστής: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης
  23. Πρόγραμμα Συνεργασία-Συνεργατικά έργα μικρής και μεσαίας κλίμακας: Τίτλος: Ταυτοποίηση ποιοτικών χαρακτηριστικών προστιθέμενης αξίας γεωργικών προϊόντων με τη χρήση μοριακής ανάλυσης, εδαφικών δεκτών και γεωπληροφορικής. Φορέας Χρηματοδοτησης: Υπουργείο Ανάπτυξης, Ελλάδα, Χρονική Διάρκεια: 2012-2015, Επιστημονικός Υπεύθυνος ΠΘ: Κ. Παπαδοπούλου, Συντονιστής: Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης

5. Δημοσιεύσεις:

Βιοτεχνολογία Φυτών-Δευτερογενής μεταβολισμός φυτών

  1. Papadopoulou K., Melton RE., Legget M., Daniels MJ. and Osbourn AE. (1999) Compromised disease resistance in saponin-deficient plants. PNAS 96:12923-12928
  2.  Osbourn AE, Carter J, Daniels M, Dufresne M., Hugouvieux V, Leggett M, Martin-Hernandez A, Melton R, Morrissey J and Papadopoulou K. (2000) Preformed antifungal compounds and plant defence. In: Biology of Plant‑Microbe Interactions Vol. 2. pp: 170-174  (Eds. PJGM DeWit, T Bisseling and WJ Stiekema). 
  3.  Osbourn AE, Carter J, Papadopoulou K, Haralampidis K, Trojanowska M and Melton R. (2000) Oat root saponins and root-infecting fungi. In: Saponins in Food, Feedstuffs and Medicinal Plants, Proceedings of the Phytochemical Society of Europe, 45, pp:121-128  (Eds. W Oleszek and A Marston). Kluwer Academic Publ., Dordrecht.
  4.  Haralampidis K, Bryan G, Qi X, Papadopoulou K, Bakht S, Melton R and A Osbourn (2001) A new class of oxidosqualene cyclases directs synthesis of antimicrobial phytoprotectants in monocots. PNAS 98: 13431-13436
  5.  I Iturbe-Ormaetxe, K Haralampidis, K Papadopoulou AE Osbourn (2003) Molecular cloning and characterization of triterpene synthases from the model legume species Medicago truncatula and Lotus japonicus. Plant Molecular Biology 51: 731-743.
  6.  Mylona POwatworakit A, Papadopoulou K, Jenner H, Qin B, Findlay K, Hill L, Qi X, Bakht S, Melton S, Osbourn A. (2008) Sad3 and Sad4 are required for avenacin A-1 biosynthesis and root development in oat. Plant Cell 20:210-212
  7.  Omirou, M., Papastylianou, I., Iori, R., Papastephanou C., Papadopoulou, K.K., Ehaliotis, C., Karpouzas, D.G., (2009) Microwave-assisted extraction of glucosinolates from Eruca sativa seeds and soil: Comparison with existing methods. Phytochemical Analysis 20: 214-220.
  8.  Omirou MD., Papadopoulou K.K., Papastylianou I., Constantinou M., Karpouzas D.G.,  Passam H., Ehaliotis C., (2009) Impact of nitrogen and sulfur fertilization on the composition of glucosinolates in relation to sulfur assimilation in different plant organs of broccoli. Journal of Agricultural and Food Chemistry 57: 9408–9417
  9.  Delis C, Krokida A, Georgiou S, Peña-Rodríguez LM, Kavroulakis N, Ioannou E, Roussis V, Osbourn AE, Papadopoulou KK (2010)Role of lupeol synthase in Lotus japonicus nodule formation, New Phytologist 189:335-346
  10.   Omirou M, PapastefanouC, Katsarou D, PapastylianouI, PassamHC, Ehaliotis C and  PapadopoulouKK(2012)  Relationships between nitrogen, dry matter accumulation and glucosinolates in Eruca sativa Mills. The applicability of the critical NO3-N levels approach. Plant and Soil, Soil, 354:347–358
  11. Osbourn AE, Papadopoulou K, Qi X, Field B, Wegel E. (2012) Finding and analysing plant secondary metabolic gene clusters (Review) Methods in Enzymology 517: 113-138
  12.   Krokida A, Delis C, Geisler K, Garagkounis C, Tsikou D, Peña-Rodríguez LM, Field B, Osbourn AE, Papadopoulou KK (2013) A metabolic gene cluster in Lotus japonicus discloses novel enzyme functions and products in triterpene biosynthesis New Phytologist 200: 675-690
  13. Mosses T, Papadopoulou KK, Osbourn AE (2014) Metabolic and functional diversity of saponins, biosynthetic intermediates and semi-synthetic derivatives. Critical Reviews in Biochemistry and Molecular BiologyDOI: 10.3109/10409238.2014.953628

Αλληλεπιδράσεις Μικροοργανισμών – Φυτών

  1. Papadopoulou K., Kavroulakis N., Tourna M. and Aggelou I. (2005) β-Glucuronidase activity correlates with fungal biomass of Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici but not with disease progression during infection of tomato. Journal of Phytopathology 153: 325-332.
  2. Kavroulakis N, Ehaliotis C, Ntougias S, Zervakis G, Papadopoulou K (2005) Local and systemic resistance against fungal pathogens of tomato plants elicited by a compost derived from agricultural residues. Physiological and Molecular Plant Pathology 66: 163-174.
  3. Kavroulakis Ν, Papadopoulou Κ, Ntougias S, Zervakis G, Ehaliotis C (2006) Cytological and other aspects of pathogenesis-related gene expression in tomato plants grown on a suppressive compost. Αnnals of Botany, Αnnals of Botany 98: 555-564
  4. Κavroulakis N, Ntougias S, Zervakis G, Ehaliotis C, Haralampidis K, Papadopoulou KK. (2007) Role of ethylene in the protection of tomato plants against fungal pathogens conferred by an endophytic Fusarium solani strain. Journal of Experimental Botany 58: 3853-3864
  5. Ntougias S., Papadopoulou KK, Zervakis GI, Kavroulakis N., Ehaliotis C (2008) Suppression of soil-borne pathogens of tomato by composts derived from agro-industrial wastes abundant in Mediterranean regions, Biology and Fertility of Soils, 44:1081-1090
  6. Ipsilantis I., Karpouzas D.G., Ehaliotis C., Papadopoulou K.K., (2009) Effects of soil application of olive mill wastewaters on the structure and function of the community of arbuscular mycorrhizal fungi. Soil Biology & Biochemistry 41 (12): 2466-2476
  7. Kavroulakis N, Ntougias S, Besi MI, Katsou P, Damaskinou A, Ehaliotis C, Zervakis GI, Papadopoulou KK (2010) Antagonistic bacteria of composted agro-industrial residues exhibit antibiosis against soil-borne fungal plant pathogens and protection of tomato plants from Fusarium oxysporum f.sp. radicis-lycopersici. Plant and Soil 333:233–247
  8. Ipsilantis I., Samourelis C., Karpouzas D.G., (2012) The impact of biological pesticides on arbuscular mycorrhizal fungi. Soil Biology and Biochemistry 45: 147-155
  9. Hadar Y, Papadopoulou KK (2012) Suppressive composts: microbial links between abiotic environments and healthy plants (Review) Annual Review of Phytopathology 50:133–53
  10. Karamanoli E., Thallasinos G., Karpouzas D.G., Bozapalidis A., Vokou D., Isis-Konstantinidou, E (2012) Are leaf glandular trichomes of oregano hospitable habitats for bacterial growth? Journal of Chemical Ecology 38(5): 476-485

Περιβαλλοντική Μικροβιολογία 

  1. Karpouzas, D.G., Walker, A., Froud-Williams, R.J., and Drennan D.S.H. (1999) Evidence for the enhanced biodegradation of ethoprophos and carbofuran in soils from Greece and the UK. Pesticide Science 55: 301-311
  2. Karpouzas, D.G., Giannakou, I.O., Walker, A., and Gowen, S.R. (1999). Reduction in biological efficacy of ethoprophos in a soil from Greece due to enhanced biodegradation: comparing bioassay with laboratory incubation data. Pesticide Science 55: 1089-1094
  3. Karpouzas, D.G., and Walker, A. (2000). Factors influencing the ability of Pseudomonas putida strains epI and II to degrade the organophosphate ethoprophos. Journal of Applied Microbiology 89: 40-48
  4. Karpouzas, D.G., and Walker, A. (2000). Factors influencing the ability of Pseudomonas putida epI to degrade ethoprophos in soil. Soil Biology & Biochemistry 32: 1753-1762
  5. Karpouzas, D.G., Morgan, J.A.W., and Walker, A. (2000). Isolation and characterisation of ethoprophos-degrading bacteria. FEMS Microbiology Ecology 33: 209-218
  6. Karpouzas, D.G., Morgan, J.A.W., and Walker, A. (2000). Isolation and characterization of 23 carbofuran-degrading bacteria from soils from distant geographical areas. Letters in Applied Microbiology 31: 353-358
  7. Karpouzas, D.G., and Walker, A. (2000). Aspects of the enhanced biodegradation and metabolism of ethoprophos in soil. Pest Management Science 56 : 540-548
  8. Karpouzas, D.G., Walker, A., Drennan, D.S.H., Froud-Williams, R.J. (2001). The effect of initial concentration of carbofuran on the development and stability of its enhanced biodegradation in top-soil and sub-soil. Pest Management Science 57: 72-81
  9. Karpouzas, D.G., and Giannakou, I.O. (2002). Biodegradation and Εnhanced Βiodegradation: A Reason for Reduced Biological Efficacy of Nematicides. Russian Journal of Nematology 10: 59-78
  10. Karpouzas, D.G., Hatziapostolou, P., Papadopoulou-Mourkidou, E., Georgiadou, A., and Giannakou I.O., (2004). The enhanced biodegradation of fenamiphos in soils from previously-treated field sites in Greece and the effect of soil fumigants on the development of the phenomenon. Environmental Toxicology & Chemistry 23: 2099-2107.
  11. Κarpouzas, D.G., Karanasios, E., Menkissoglou-Spiroudi, U., (2004). Enhanced microbial degradation of cadusafos in soils from potato monoculture: Demonstration and characterization, Chemosphere 56: 549-559
  12. Κarpouzas, D.G., Karanasios, E., Giannakou I.O., Georgiadou, A., and Menkissoglou-Spiroudi, U., (2004) The effect of soil fumigants methyl bromide and metham sodium on the microbial degradation of the nematicide cadusafos. Soil Biology & Biochemistry 37: 541-550.
  13. Giannakou, I.O., Karpouzas, D.G., Anastasiades, I., Tsiropoulos, N.G., and Georgiadou, A., (2005). Factors affecting the efficacy of non-fumigant nematicides for the control of root-knot nematodes. Pest Management Science 61 (10), 961-972.
  14. Karpouzas, D.G., Fotopoulou, A., U. Menkissoglu-Spiroudi, Singh, B.K. (2005). Non-specific biodegradation of the organophosphorus pesticides, cadusafos and ethoprophos, by two bacterial isolates. FEMS Microbiology Ecology 53: 369-378.
  15. Karpouzas, D.G. and Singh, B.K. (2006) Phosphorus containing xenobiotics: microbial degradation, metabolic pathways and molecular basis. Advances in Microbial Physiology 51: 119-186.
  16. Dolaptsoglou, C., Karpouzas, D.G., Menkissoglu-Spiroudi, U., Eleftherohorinos I., and Voudrias, E.A (2007). Influence of different organic amendments on the degradation, metabolism and adsorption of terbuthylazine. Journal of Environmental Quality 36:1793-1802.
  17. Kravariti K., Tsiropoulos N., Karpouzas D.G., (2010) Terbuthylazine and chlorpyrifos fate in various biomix substrates originated from composted cotton crop residues. Pest Management Science 66 (10): 1122-1128
  18.  Karanasios E, Tsiropoulos N, Karpouzas D.G., Menkissoglu-Spiroudi U., (2010) Novel biomixtures based on local Mediterranean ligninocellulosic materials: evaluation for use in biobeds. Chemosphere 80: 914-921
  19.  Karanasios, E., Tsiropoulos, N., Karpouzas, D.G., Ehaliotis C., (2010) Degradation and adsorption of pesticides in compost-based biomixtures as potential substrates for biobeds in south Europe. Journal of Agricultural and Food Chemistry 58: 9147-9156
  20.  Karas P., Perucchon C., Exarhou C., Ehaliotis C., Karpouzas DG., (2011) Potential for bioremediation of agro-industrial effluents with high loads of pesticides by selected fungi. Biodegradation 22: 215-228
  21.  Chanika E., Soueref E., Georgiadou D, Karas P., Karanasios E., Tsiropoulos N., Tzortzakakis E., Karpouzas D.G., (2011) Isolation of soil bacteria able to hydrolyze both organophosphate and carbamate pesticides. Bioresource Technology 102 (3): 3184-3192
  22. De Wilde, T., Capri E., Hunsby J, Castillo M.d.P., Karpouzas D.G., Nilsson E., Spliid N.H., (2011) 3rd European biobed workshop. Environmental Science and Pollution Research 18(1): 132-134
  23.  Karanasios E., Karpouzas D.G., Tsiropoulos N., (2012) Key parameters and pesticide practices controlling pesticide degradation efficiency of biobed substrates. Journal of Environmental Science and Health PartB 47(6): 589-598
  24.  Omirou M, Dalias P., Costa C., Papastefanou C., Dados A., Ehaliotis C., Karpouzas D.G., (2012) Exploring the potential of biobeds for the depuration of pesticide-contaminated wastewaters from the citrus production industry: laboratory, column and field studies. Environmental Pollution 166: 31-39
  25.  Karanasios E., Papadi-Psyllou A., Karpouzas D.G., Tsiropoulos N. (2012) Optimization of water management and biomixture composition for maximizing the pesticide depuration of peat-free biobed systems. Journal of Environmental Quality 41(6): 1787-1795
  26. Karanasios E. Tsiropoulos N. Karpouzas D.G., (2012) On-farm biopurification systems for the depuration of pesticide-wastewaters: recent advances and future perspectives. Biodegradation 23(6): 787-802
  27. Rayu S., Karpouzas D.G., Singh B.K. (2012) Emerging technologies in bioremediation: constraints and opportunities. Biodegradation 23(6): 917-926
  28.  Omirou M, Karpouzas D.G., Papadopoulou KK., Ehaliotis C. (2013) The decomposition of pure and plant – derived glucosinolates in soil. European Journal of Soil Biology 56:49-55
  29. Karanasios E., Karpouzas D.G., Tsiropoulos N., (2013) Quantitative and qualitative differences in the metabolism of pesticides in biobed substrates and soil. Chemosphere 93(1): 20-28
  30.  Perruchon C., Patsioura V., Vasiliadis, S. Karpouzas D.G., (2015) Isolation and characterisation of a Sphingomonas strain able to degrade the fungicide ortho-phenylphenol. Pest Management Science DOI: 10.1002/ps.3970 (early view)

 Μικροβιακή Οικολογία  

  1. Ehaliotis C, Papadopoulou K, Kotsou M, Mari I and  C Balis (1999) Adaptation, population dynamics and N2-fixation of Azotobacter vinelandii in olive-mill wastewaters during an aerobic bioremediation process. FEMS Microbiology-Ecology, 30: 301-311.
  2. Giannakou, I.O., Karpouzas, D.G., Prophetou-Athanasiadou, D., (2004). A novel non-chemical nematicide for the control of root-knot nematodes. Applied Soil Ecology 26: 69-79
  3. Ntougias S, Zervakis GI, Kavroulakis N, Ehaliotis C, Papadopoulou K (2004) Bacterial diversity in spent mushroom compost assessed by amplified rDNA restriction analysis and sequencing of cultivated isolates. Systematic and Applied Microbiology 27: 746-754
  4. Ntougias S, Ehaliotis C, Papadopoulou K, Zervakis G. (2006) Application of respiration and FDA hydrolysis measurements for estimating microbial activity during composting processes. Biology and Fertility of Soils 42: 330-337
  5. Ntougias S, Zervakis G, Kavroulakis N, Ehaliotis C, Papadopoulou K. (2006) Ecophysiology and molecular phylogeny of bacteria isolated from alkaline two-phase olive mill wastes. Research in Microbiology 157: 376-385
  6. Ntougias S., Papadopoulou KK, Zervakis GI, Kavroulakis N., Ehaliotis C. (2008) Suppression of soil-borne pathogens of tomato by composts derived from agro-industrial wastes abundant in Mediterranean regions, Biology and Fertility of Soils 44: 1081-1090
  7. Spyrou I.M., Karpouzas D.G., Menkissoglu-Spiroudi, U., (2009). Do botanical pesticides alter the structure of the soil microbial community. Microbial Ecology 58: 715-727
  8. Karpouzas D.G., Rousidou C., Papadopoulou K.K, Bekris F., Zervakis G., Singh B.K., Ehaliotis C., (2009). Effect of continuous olive mill wastewater applications, in the presence and absence of N fertilization, on the structure of rhizopshere soil fungal communities. FEMS Microbiology Ecology 70: 56-69
  9. Karpouzas, D.G., Singh B.K., (2009) Chapter 5: Application of fingerprinting molecular methods in bioremediation studies. In Bioremediation, Methods in Molecular Biology 599, Cummings S.P. Ed., Humana Press Inc., pp 69-88.
  10. Rousidou C., Papadopoulou KK., Zervakis G., Singh B.K., Ehaliotis C., Karpouzas, D.G., (2010) Fractioned land application of diluted olive mill wastewater induces changes in the structure of the soil microbial community. European Journal of Soil Biology 46: 34-4
  11. Karpouzas D.G., Ntougias S., Iskidou E., Rousidou C., Papadopoulou K.K., Zervakis G., Ehaliotis C., (2010) The effects of soil application of olive mill wastewaters on functional soil bacterial communities. Applied Soil Ecology 45: 101-111.
  12. Omirou, C. Rousidou, F. Bekris, K.K. Papadopoulou, C. Ehaliotis, U. Menkissoglu-Spiroudi, D.G. Karpouzas. (2011) Τhe impact of biofumigation and chemical fumigation methods on the structure and function of the soil microbial community. Microbial Ecology 61: 201-213
  13.  Papadopoulou E.S., Karpouzas D.G., Menkissoglu-SpiroudiU., (2011) Extraction parameters significantly influence and the quantity and the profile of PLFAs extracted from soil. Microbial Ecology 62: 704-714
  14.  Karpouzas D.G., Karatasas A., Spyridaki E., Rousidou C., Bekris F., Ehaliotis C., Papadopoulou K.K. (2011) Impact of a beneficial and of a pathogenic Fusarium strain on the fingerprinting-based structure of microbial communities in tomato (Lycopersicon esculentum Milll.) rhizosphere. European Journal of Soil Biology 47(6): 400-408
  15.  Puglisi E., Vasileiadis S., Demiris, C., Bassi D., Karpouzas D.G., Capri E., Cocconcelli PS., Trevisan M., (2012) Fungicides impact on the diversity and function of non-target ammonia oxidizing microorganisms residing in a litter soil cover. Microbial Ecology 64: 692-701
  16. Marinozzi M, Coppola L., Monaci E, Karpouzas D.G., Papadopoulou E, Menkissoglu-Spiroudi U., Vischetti C., (2013) The dissipation of three fungicides in a biobed organic substrate and their impact on the structure and activity of the microbial community. Environmental Science and Pollution Research 20:2546-2555
  17.  Martin-Laurent F, Kandeler E., Pertic I, Djuric S, Karpouzas D.G., (2013) ECOFUN-MICROBIODIV: an FP7 European project for developing and evaluating innovative tools for assessing the impact of pesticides on soil functional microbial diversity-towards new pesticide registration regulation? Environmental Science and Pollution Research 20:1203-1205
  18. Moulas C., Petsoulas C., Rousidou C., Perruchon C., Karras P., Karpouzas D.G., (2013) The effects of systemic pesticides imidachloprid and metalaxyl on the phyllosphere of pepper plants. BIOMED Research International Volume 2013 Article ID 969750, 8 pageshttp://dx.doi.org/10.1155/2013/969750
  19. Rousidou C., Papadopoulou E., Kortsinidou M., Giannakou I.O., Singh B.K., Menkissoglu-Spiroudi, U., and Karpouzas D.G.,(2013) Bio-pesticides: Harmful or harmless to ammonia oxidizing microorganisms? The case of a Paecilomyces lilacinus-based nematicide. Soil Biology & Biochemistry 67:98-105
  20. Karpouzas D.G., Papadopoulou, E, Ipsilantis I., Petric I., Udikovic-Kolic N., Djuric S., Kandeler E., Menkissoglu-Spiroudi U., Martin-Laurent F., (2013) Effects of nicosulfuron on the abundance and diversity of arbuscular mycorrhizal fungi used as indicators of pesticide soil microbial toxicity. Ecological Indicators 39: 44-53
  21.  Karpouzas, D.G., Kandeler, E., Bru, D., Friedel, I., Auer, Y., Kramer, S., Vasileiadis, S., Petric, I., Udikovic-Kolic, N., Djuric, S., Martin-Laurent, F. (2014) A tiered assessment approach based on standardized methods to estimate the impact of nicosulfuron on the abundance and function of the soil microbial community. Soil Biology and Biochemistry 75: 282-291

Περιβαλλοντική Ρύπανση

  1. Papadopoulou-Mourkidou, E., Karpouzas, D.G. Patsias, J., Kotopoulou, A., Milothridou, K., Kintzikoglou, K., and Vlachou, P., (2004). The potential of pesticides to contaminate the groundwater resources of the Axios river basin in Macedonia, Northern Greece. Part I. Monitoring study in the north part of the basin. The Science of the Total Environment 321: 127-146.
  2. Papadopoulou-Mourkidou, E., Karpouzas, D.G. Patsias, J., Kotopoulou, A.,     Milothridou, K., Kintzikoglou, K., and Vlachou, P., (2004). The potential of pesticides to contaminate the groundwater resources of the Axios river basin. Part II. Monitoring study in the south part of the basin. The Science of the Total Environment 321: 147-164.
  3. Tsiropoulos, N.G., Lykas, D.T., and Karpouzas, D.G. (2005) Liquid chromatographic determination of fosthiazate residues in environmental samples and application of the method to a fosthiazate field dissipation study. Journal of AOAC International 88 (6),1827-1833
  4. Ferrari, F., Karpouzas, D.G., Trevisan, M., Capri, E. (2005). Predicting and measuring the environmental concentration of pesticides in air after application to paddy water systems. Environmental Science and Technology 39 (9), 2968-2975.
  5. Karpouzas, D.G., Ferrero A, Vidotto F, Capri E. (2005). Application of the RICEWQ-VADOFT model for simulating the environmental fate of pretilachlor in rice paddies. Environmental Toxicology & Chemistry 24 (4), 1007-1017.
  6. Karpouzas, D.G., Capri, E. and Papadopoulou-Mourkidou, E. (2006) Basin-scale risk assessment in rice paddies: An example based on the Axios river basin in Greece. Vadose Zone Journal 5 (2) 273-282.
  7. Karpouzas, D.G., Cervelli, S, Watanabe H, Capri E, and Ferrero A. (2006) Pesticide exposure assessment in rice paddies in Europe: a comparative study of existing mathematical models. Pest Management Science 62 (7), 624-636.
  8. Karpouzas, D.G., Riparbelli C., Pastori, M., Capri, E. (2006) Landscape risk analysis of pesticides applied to rice paddies. Agronomy for Sustainable Development 26: 167-177.
  9. Pantelelis, I. Karpouzas, D.G., Menkissoglu-Spiroudi, U., and Tsiropoulos, N.G. (2006). Influence of soil physicochemical and biological properties on the degradation and adsorption of the nematicide fosthiazate. Journal of Agricultural and Food Chemistry 54: 228-237
  10. Karpouzas, D.G., Pantelelis I., Menkissoglu-Spiroudi U., Tsiropoulos, N.G., Golia E., (2007). Leaching of the organophosphorus nematicide fosthiazate. Chemosphere 68: 1359-1364
  11. E. Capri, D.G. Karpouzas (2008). Pesticide risk assessment in rice paddies: Theory and Practice, Elsevier BV, Amsterdam, The Netherlands, ISBN: 978-0-444-53087-5.
  12. Karpouzas, D.G., and Miao, Z. (2008). Higher tier exposure assessment in rice paddy areas: a European perspective. In  Pesticide risk assessment in rice paddies: Theory and Practice, Capri E., and D.G. Karpouzas Eds., Elsevier BV , The Netherlands, ISBN: 978-0-444-53087-5, pp. 125-164.
  13. Dolaptsoglou, C., Karpouzas, D.G., Menkissoglu-Spiroudi, U., Eleftherohorinos I., and Voudrias, E.A (2009). Influence of different organic amendments on the leaching and dissipation of terbuthylazine in a column and a field study. Journal of Environmental Quality 38: 782-791
  14.   Tsohatzis E., Karpouzas D.G., Menkissoglu-Spiroudi, U, Tzimou-Tsitouridou R (2010) A multi-residue method for pesticide residue analysis in rice grains using matrix solid phase dispersion extraction and high performance liquid chromatography - diode array detection. Analytical and Bioanalytical Chemistry 397: 2181-2190
  15. Tsohatzis E.D., Tzimou-Tsitouridou R., Menkissoglu-Spiroudi U., Karpouzas D.G., Papageorgiou M. (2012) Development and validation of an HPLC-DAD method for the simultaneous determination of most common rice pesticides in paddy water systems. International Journal of Environmental and Analytical Chemistry 92(5): 548-560
  16.    Tsohatzis E.D., Tzimou-Tsitouridou R Menkissoglu-Spiroudi, U, Karpouzas D.G., Katasantonis D. (2013) Dissipation of tricyclazole, profoxydim and penoxsulam in rice paddy systems: Laboratory and field studies. Chemosphere 91(7): 1049-1057

6. Διατριβές: 

              Πτυχιακές διατριβές

  1. Ρουσίδου Κωνσταντίνα (2007) Η επίδραση υγρών αποβλήτων ελαιουργείων (κατσίγαρος) στην σύσταση της μικροβιακής κοινότητας τους εδάφους (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας
  2. Ισκίδου Ευδοκία (2007) Αξιολόγηση της επίδρασης υγρών αποβλήτων ελαιουργείων στην σύσταση της βακτηριακής κοινότητας του εδάφους (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  3.  Γεωργίου Σοφία (2008) Διερεύνηση του φυσιολογικού ρόλου της συνθάσης της λουπεόλης σε ρίζες και φυμάτια του φυτού Lotus japonicus (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  4.  Αποστολίδη Μαρία (2008) In vivo και in vitro πειράματα για την απομόνωση του συστήματος γονιδίου-ενζύμου που είναι υπεύθυνο για την υδρόλυση του οργανοφωσφορικού νηματωδοκτόνου cadusafos από τα βακτηριακά στελέχη  Flavobacterium johnsoniae  και Sphingomonas paucimobilis(Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  5.  Chiara Perruchon (2009) Evaluation of selected fungi to degrade pesticides contained in wastewaters from the fruit – packaging industry and involvement of lignolytic enzymes. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  6.   Σπυριδάκη Ευαγγελία (2010) Μελέτη των μεταβολών της βακτηριακής κοινότητας της ριζόσφαιρας του φυτού της τομάτας έπειτα από τον εμβολιασμό με ένα παθογόνο (Fusarium oxysporum f.sp. radicis lycopersici) και ένα μη παθογόνο στέλεχος του γένους Fusarium (Fusarium solani) (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  7.  Γκαραγκούνης Κωνσταντίνος (2010) Σίγηση του γονιδίου ΑΜΥ2 στις ρίζες του Lotus japonicus (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  8. Γαρυφαλλοπούλου Ζωή (2010) Μελέτη των επιδράσεων των υγρών αποβλήτων ελαιουργείου στην βακτηριακή κοινότητα υπολειμμάτων καλλιέργειας βαμβακιού κατά την διάρκεια της κομποστοποίησης (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  9.  Πλέσσα Αλεξάνδρα (2010) Έκφραση της συνθάσης της λουπεόλης σε αναπτυσσόμενα φυτά Lotus japonicus (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  10. Τοματσίδου Αναστασία (2011) AtNoc, μια νέα αποαδενυλάση που ρυθμίζεται από τον κιρκάδιο ρυθμό στο Arabidopsis thaliana. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  11. Ευτυχία Σουέρεφ (2011) Μικροβιακή διάσπαση επιλεγμένων οργανοφωσφορικών και καρβαμιδικών εντομοκτόνων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας
  12. Τσουκάτου Γεωργία (2012) Η επίδραση της θειικής λίπανσης στην παραγωγή γλυκοσινολικών οξέων στους ιστούς της ρόκας (Eruca sativa) (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  13. Ψαρράκου Ιωάννα-Σοφία (2012) Οι πρωτείνες που φέρουν επαναλήψεις Arm και ο ρόλος τους στη συμβίωση ψυχανθών – ριζόβιων (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου
  14. Αντωνόπουλος Διονύσης (2012) Υπερέκφραση και καθαρισμός του πολυπεπτιδίου CYP79B2 μιας μονοξυγενάσης κυτοχρώματος P450 η οποία εμπλέκεται στην βιοσύνθεση των ινδολικών γλυκοσινολικών οξέων στο φυτό Eruca sativa. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  15. Πανταζή Μαρία (2012) Σταθερός μετασχηματισμός φυτών Lotus japonicus cv. MG20 μέσω Agrobacterium tumefaciens με στόχο την απόκτηση φυτών ελέγχου με ανθεκτικότητα στο αντιβιοτικό hygromycin. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  16. Κουφογιάννης Αστέριος (2012) Σίγηση του γονιδίου CYP71D353 που εμπλέκεται στη βιοσύνθεση τριτερπενοειδών στο φυτό Lotus japonicus. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου
  17. Μαρία Τσαγγάρη (2012) Αξιολόγηση υποστρωμάτων με τον εδώδιμο μύκητα Pleurotus ostreatus για την αποτοξικοποίηση υγρών αποβλήτων επιβαρυμένων με τα μυκητοκτόνα ortho-phenylphenol και imazalil. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  18.   Nτάλλας Γεώργιος (2013) Παροδικός μετασχηματισμός του γονιδίου της συνθάσης της β-αμυρίνης στο φυτό Medicago truncatula. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  19. Μπέλλα Τσαχίδου (2013) Μελέτη της επίδρασης μυκητοκτόνων που περιέχονται σε απόβλητα συσκευαστηρίων φρούτων στην λειτουργία της μικροβιακής κοινότητας του εδάφους. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  20.  Θέμης Αστέρης (2013) Η επίδραση του ζιζανιοκτόνου nicosulfuron στην κοινότητα των νιτρωδοποιητικών αρχαίων και βακτηρίων του εδάφους. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  21.   Άννα Γρηγοροπούλου (2013) Εκτίμηση του πληθυσμού επιλεγμένων εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων σε γεωργικά εδάφη. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  22. Φλώρα Σπέντζα (2014) Μελέτη της αποδόμησης των εντομοκτόνων ethoprophos και chlorpyrifos σε εδάφη από περιοχές καλλιέργειας πατάτας στην Ελλάδα (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  23.   Γιώργος Παπουτσιδάκης (2014) Μοριακή ανάλυση του γονιδίου HRAS σε καρκινώματα θυρεοειδούς στον ελληνικό πληθυσμό (Επιβλέπουσα: Κ. Λιαδάκη)
  24. Χρυσάνθη Μοσχανδρέα (2014) Μελέτη της βιοχημικής δράσης του βετουλινικού οξέος στην ανάπτυξη ανθρώπινων καρκινικών κυττάρων μαστού και τραχήλου της μήτρας (Επιβλέπουσα: Κ. Λιαδάκη)
  25.   Κατερίνα Μαραγκού (2014) Επίδραση εκχυλισμάτων ρόκας (Eruca sativa) στην ανάπτυξη ανθρωπίνων καρκινικών κυττάρων τραχήλου της μήτρας (Επιβλέπουσα: Κ. Λιαδάκη)

     

            Μεταπτυχιακές διατριβές

  • Κατσαρού Δήμητρα (2008) Απομόνωση και χαρακτηρισμός γονιδίων που συμμετέχουν στη βιοσύνθεση γλυκοσινολικών οξέων στη ρόκα (Εruca sativa) (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Μπεκρής Φώτης (2008) Γονιδιακή έκφραση κατά την αλληλεπίδραση φυτών τομάτας με ένα μη παθογόνο στέλεχος Fusarium solani (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Καράς Παναγιώτης (2009) Αξιολόγηση διαφόρων στελεχών μυκήτων λευκής σήψης ως φορείς βιολογικής αποκατάστασης από ρύπανση με γεωργικά φάρμακα (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Σαμουρέλης Κωνσταντίνος (2009) Αξιολόγηση των επιδράσεων φυτοπροστατευτικών προϊόντων βοτανικής προέλευσης σε θυσανώδεις μυκορριζικούς μύκητες (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Αντωνιάδης Κωνσταντίνος (2009) Ανάπτυξη και αξιολόγηση ενδογενών μυκορριζικών μυκήτων ως εμβόλια για βελτίωση της θρέψης φυτών πιπεριάς και τομάτας σε συστήματα βιολογικής γεωργίας  (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Χανίκα Ελένη (2010) Απομόνωση και ταυτοποίηση βακτηρίων με την ικανότητα αποδόμησης των εντομοκτόνων-νηματωδοκτόνων fenamiphos και oxamyl (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας).
  • Εξάρχου Κατερίνα (2010) Μελέτη της διάσπασης μυκητοκτόνων που περιέχονται σε υγρά απόβλητα από την μετασυλλεκτική μεταχείριση φρούτων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Σαββανάκη Αθηνά (2010) Αξιολόγηση ενδογενών μυκορριζικών πληθυσμών ως φορείς ενίσχυσης φυτικής ανάπτυξης σε επίπεδο αγρού (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Τζέβος Κωνσταντίνος (2010) Μελέτη της έκφρασης γονιδίων που εμπλέκονται στη βιοσύνθεση των τριτερπενοειδών στο φυτό Lotus japonicus (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Ποδιά Βαρβάρα (2010) Υποκυτταρικός εντοπισμός δύο ισομορφών της υπεροξειδάσης της γλουταθειόνης του φυτού Medicago truncatula (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Δεμίρης Κωνσταντίνος (2010) Μελέτη της επίδρασης των μυκητοκτόνων cyprodinil και penconazole στην σύσταση και λειτουργία της κοινότητας των νιτρωδοποιητικών Βακτηρίων και Αρχαίων σε στρώμα φυτικών υπολειμμάτων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Αναστασιάδου Βηθλεέμ (2010) Η επίδραση των ενδογενών επιπέδων φυτοορμονών στην ικανότητα αποικισμού φυτών ντομάτας (αγρίου τύπου και μεταλλαγμάτων) από ένα μη παθογόνο στέλεχος Fusarium solani (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Πούλιος Σωκράτης (2010) Αλληλεπίδραση δενδρόμορφων μυκορριζικών στελεχών με τον ενδοσυμβιωτικό μύκητα Fusarium solani στέλεχος FsK σε ρίζες τομάτας (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Γεωργιάδου Δάφνη (2010) Αξιολόγηση της ικανότητας βακτηρίων να διασπούν τα νηματωδοκτόνα fenamiphos και oxamyl και απομόνωση των γονιδίων που εμπλέκονται στην υδρόλυση του oxamyl (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Ρουσίδου Κωνσταντίνα (2010) Επίδραση συνθετικών και βιολογικών γεωργικών φαρμάκων στη δομή και την αφθονία των νιτρωδοποιητικών βακτηρίων και αρχαίων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Μούλας Κωνσταντίνος (2011) Συνέχιση της μελέτης της επίδρασης διασυστηματικών γεωργικών φαρμάκων στην σύσταση της κοινότητας των επίφυτων μυκήτων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Πατσιούρα Βασιλική (2011) Απομόνωση και ταυτοποιηση βακτηρίων με την ικανότητα αποδόμησης του μυκητοκτόνου ortho-phenylphenol (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Κορτσινίδου Μαριάννα (2012) Μελέτη του μηχανισμού δράσης του βιολογικού νηματωδοκτόνου BIOACT® (Paecilomyces lilacinus) στην αφθονία των νιτρωδοποιητικών βακτηρίων και αρχαίων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Καραίσκος Διονύσης (2012) Μελέτη του μηχανισμού αποδόμησης του καρβαμιδικού νηματωδοκτόνου/εντομοκτόνου oxamyl σε διάφορα έδαφη από την Κρήτη (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Κωνσταντίνα Μανίκα (2013) Αποδόμηση του μυκητοκτόνου ortho-phenylphenol σε εξαντλημένο υπόστρωμα μανιταριών από τα βακτηριακά στελέχη Pseudomonas azelaica PHB-1 και Pseudomonas stutzeri OPP26 (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Μαρία Μετσοβίτη (2013) Μελέτη της αποδόμησης γεωργικών φαρμάκων που χρησιμοποιούνται στα συσκευαστήρια φρούτων σε λυματολάσπη από την μονάδα επεξεργασίας αστικών αποβλήτων της πόλης της Λάρισας (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Παναγιώτης Κολοβός (2013) Απομόνωση βακτηρίων που υδρολύουν το καρβαμιδικό εντομοκτόνο oxamyl και διερεύνηση του μηχανισμού αποδόμησης του κύριου μεταβολικού προϊόντος που προκύπτει (oxamyl oxime) (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Σωτηρία Μακρή (2013) Μελέτη της ικανότητας κατακράτησης και διάσπασης των μυκητοκτόνων ortho-phenylphenol και imazalil που περιέχονται σε υγρά απόβλητα από τα συσκευαστήρια φρούτων από επιλεγμένα οργανικά υποστρώματα (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  •  Κωνταντίνος Πετσούλας (2013) Φυλλόσφαιρα: Οι αντιδράσεις ενός ανεξερεύνητου μικροβιακού κόσμου σε διαφυλλικές και εδαφικές εφαρμογές γεωργικών φαρμάκων (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Στεφανία Σιτρά (2014) Μεταβολές στον πληθυσμό των βακτηρίων σε βιοκλίνες που χρησιμοποιήθηκαν για την επεξεργασία αποβλήτων από τα συσκευαστήρια φρούτων. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Ζήσης Βασίλειος (2015) Σύνθεση και χρωματογραφική ανάλυση των προϊόντων μεταβολισμού του αντιοξειδωτικού ethoxyquin - Εφαρμογή στην μελέτη της αποδόμησης του σε οργανικά υποστρώματα. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Μάνθου Έλενα (2015) Μεταβολές στον πληθυσμό των μυκήτων σε πιλοτικές βιοκλίνες που χρησιμοποιήθηκαν για την επεξεργασία των αποβλήτων από τα συσκευαστήρια φρούτων. (Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας)
  • Χρυσούλα Θύμνιου (2013) Επίδραση εκχυλισμάτων ρόκας (Eruca sativa) στην ανάπτυξη ανθρωπίνων καρκινικών κυττάρων (Επιβλέπουσα: Κ. Λιαδάκη)
  • Ηρώ Παππά (2013) Επίδραση εκχυλισμάτων ρόκας και απομονωμένων γλυκοσινολικών οξέων σε καρκινικές σειρές (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)
  • Αλεξάνδρα Παπαδοπούλου (2015) Μοριακή ανάλυση των γονιδίων KRAS και HRAS στον καρκίνο του θυρεοειδούς. (Επιβλέπουσα: Κ. Λιαδάκη)
  • Νταφόπουλος Σωτήριος (2015) Έλεγχος αλληλεπίδρασης της πρωτείνης HESP1 του Arabidopsis thaliana με τις πρωτεϊνες OXT6 και GRP7. (Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου)

             Διδακτορικές διατριβές

  • Chiara Perruchon: Μελέτη των μοριακών μηχανισμών στην αποτοξικοποίηση μυκητοκτόνων που περιέχονται σε υγρά απόβλητα αγροτικής προέλευσης, Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας (2014)
  • Κατσαρού Δήμητρα: Βιοσύνθεση και ρύθμιση του μεταβολισμού των γλυκοσινολικών οξέων στο φυτό Εruca sativa, Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου (2013)
  • Αφροδίτη Κροκυδά: Bιοσύνθεση και ρόλος των τριτερπενοειδών στην ανάπτυξη και λειτουργία της ρίζας και των φυματίων στο ψυχανθές φυτό-μοντέλο Lotus japonicus Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου (2013)
  • Ιωάννα Μύρτζιου: Ο ρόλος του νιτρικού οξέος στο αντιοξειδωτικό σύστημα φυτών Medicago truncatula Επιβλέπουσα: Κ. Παπαδοπούλου (2012)
  • Παναγιώτης Καράς: Βιολογική επεξεργασία υγρών αποβλήτων επιβαρυμένων με γεωργικά φάρμακα, Επιβλέπων: Δ. Καρπούζας (στο στάδιο της συγγραφής)
  • Κωνσταντίνα Ρουσίδου: Μελέτη της δυναμικής γονιδίων που εμπλέκονται στην αποδόμηση οργανοφωσφορικών και καρβαμηδικών γεωργικών φαρμάκων (μη ολοκληρωμένη)
  • Βασιλική Σκιαδά: Ενδοφυτικοί Μύκητες στις ρίζες των φυτών: πρότυπα αποικισμού και μηχανισμοί δράσης προστασίας σε συνθήκες αβιοτικών και βιοτικών καταπονήσεων (μη ολοκληρωμένη)
  • Αθανασία Κατσούλα: Μελέτη της λειτουργίας και ποικιλότητας της μικροβιακής κοινότητας στην φυλλόσφαιρα φυτών και αλληλεπιδράσεις με το περιβάλλον (μη ολοκληρωμένη)
  • Παναγιώτα Μάρκου: Ποικιλότητα τριτερπενίων σε καλλιεργούμενα ψυχανθή: βιοσυνθετικά μονοπάτια και βιολογικές δράσεις

Ερευνητικός Εξοπλισμός

Αναλυτικός Εξοπλισμός
• HPLC-UV
• HPLC-PDA
• Rotavap
• Ζυγοί υψηλής ακρίβειας (4 δεκαδικά ψηφία)(2)
• Φορητοί ζυγοί δύο δεκαδικών ψηφίων (2)

Εξοπλισμός Μοριακής Βιολογίας
• MultiBlock PCR
• DGGE
• Συστήματα οριζόντιας και κάθετης ηλεκτροφόρησης για νουκλεικά οξέα και πρωτείνες
• PCR πραγματικού χρόνου
• Qubit 2v για ποσοτικοποίηση νουκλεικών οξέων και πρωτεινών

Εξοπλισμός Μικροβιολογίας
• Θάλαμοι νηματικής ροής (2)
• Ψυχώμενοι επωαστικοί θάλαμοι με ανάδευση (3)
• Μικροβιολογικοί επωαστικοί θάλαμοι (2)
• Φωτόμετρο UV-VIS
• Αναδευτήρες (3)
• Λουτρό υπερήχων
• pH μετρο
• Υδατόλουτρο
• Vortexes
• Σύστημα Υπερκαθαρου νερού
• Επιτραπέζια ψυχώμενη φυγόκεντρος
• Μικρές φυγόκεντροι για eppendorfs (3)
• Σύστημα αποστείρωσης - κλίβανος (100 L)
• Καταψύκτες (-20°C) (4)
• Υπερκαταψύκτης (-80°C)
• Ψυγεία (2)

Παροχή Υπηρεσιών

1. Παρακολούθηση και εκτίμηση της περιβαλλοντικής τύχης και συμπεριφοράς γεωργικών φαρμάκων - Εκτίμηση της επικινδυνότητας.

Υπάρχοντα Προγράμματα Παροχής Υπηρεσιών: Μελέτη της αποδόμησης των εντομοκτόνων fipronil, fosthiazate, chlorpyrifos και ethroprophos σε περιοχές καλλιέργειας πατάτας στην Ελλάδα

2. Εκτίμηση του φορτίου των εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων σε αγροτικά εδάφη με την χρήση διαγνωστικών μεθόδων PCR πραγματικού χρόνου

Υπάρχοντα Προγράμματα Παροχής Υπηρεσιών:
i) Μελέτη της επίδρασης ενός νέου καπνιστικού εδάφους στον πληθυσμό εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων σε θερμοκηπιακές καλλιέργειες με την χρήση PCR πραγματικού χρόνου
ii) Αξιολόγηση του φορτίου των βασικότερων εδαφογενών φυτοπαθογόνων μυκήτων σε αγροτικά εδάφη θερμοκηπιακών καλλιεργειών από την Δυτική Πελοπόννησο με την χρήση PCR πραγματικού χρόνου

3. Αναγνώριση και ταυτοποίηση μυκήτων και βακτηρίων που προσβάλουν φυτικούς ιστούς και μεταποιημένα αγροτικά προϊόντα

4. Εκτίμηση μικροβιακού φορτίου που προκαλεί υποβάθμιση σε φυτικά προϊόντα που προορίζονται για φαρμακευτική ή διατροφική χρήση

5. Ανάπτυξη καινοτόμων βιοτεχνολογικών προϊόντων που προωθούν την γεωργική παραγωγή (πχ. Μυκορριζικά εμβόλια, Ωφέλιμοι ενδοφυτικοί μύκητες)

Υπάρχοντα Προγράμματα Παροχής Υπηρεσιών:
i) Απομόνωση αυτόχθονων δενδρόμορφων μυκορριζικών μυκήτων και ανάπτυξη μυκορριζικών εμβολίων για τον εμβολιασμό της ριζόσφαιρας και την παραγωγή βελτιωτικών εδάφους (συνεργασία με την εταιρεία ΦΥΤΟΘΡΕΠΤΙΚΉ);
ii) Αξιολόγηση των δενδρόμορφων μυκορριζικών μυκήτων ως βιοτεχνολογικο εργαλείο για την βελτιστοποίηση της πρόσληψης Ρ από τα φυτά (σε συνεργασία με την εταιρεία NATURE)

6. Αξιολόγηση ενδημικών φυτών ως πηγές ανάπτυξης νέων γεωργικών φαρμάκων βοτανικής προέλευσης

7. Ανάπτυξη μικροβιακών εμβολίων με προοπτική χρήσης σε συστήματα επεξεργασίας υγρών αποβλήτων

8. Επεξεργασία υγρών αποβλήτων επιβαρυμένων με γεωργικά φάρμακα που προκύπτουν από αγροτικές πρακτικές ή από λοιπές αγροτικές βιομηχανίες (πχ. ΒΙΟΚΛΙΝΕΣ)

 

7. Φωτογραφικό Υλικό: 

lab karpouza1 lab karpouza2 lab karpouza3

 

8. Συνδέσεις: 

 

9. Επικοινωνία:

Αν. Καθηγήτρια Κ. Παπαδοπούλου
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας
Πλούτωνος 26 και Αιόλου
41221 Λάρισα
Τηλ. 2410-565244
Φαξ. 2410-565290
Email. Αυτή η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου προστατεύεται από κακόβουλη χρήση. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε την Javascript για να τη δείτε.

Αν. Καθηγητής Δ. Καρπούζας
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας
Πλούτωνος 26 και Αιόλου
41221 Λάρισα
Τηλ. 2410-565294
Φαξ. 2410-565290
Email. Αυτή η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου προστατεύεται από κακόβουλη χρήση. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε την Javascript για να τη δείτε.

Επίκ. Καθηγήτρια Καλλιόπη Λιαδάκη
Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
Τμήμα Βιοχημείας και Βιοτεχνολογίας
Πλούτωνος 26 και Αιόλου
41221 Λάρισα
Τηλ. 2410-565260
Φαξ. 2410-565290
Email: Αυτή η διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου προστατεύεται από κακόβουλη χρήση. Χρειάζεται να ενεργοποιήσετε την Javascript για να τη δείτε.

 

 

 

 

        

1.   Papadopoulou K., Melton RE., Legget M., Daniels MJ. and Osbourn AE. (1999) Compromised disease resistance in saponin-deficient plants. PNAS 96:12923-12928

2.   Osbourn AE, Carter J, Daniels M, Dufresne M., Hugouvieux V, Leggett M, Martin-Hernandez A, Melton R, Morrissey J and Papadopoulou K. (2000) Preformed antifungal compounds and plant defence. In: Biology of Plant‑Microbe Interactions Vol. 2. pp: 170-174  (Eds. PJGM DeWit, T Bisseling and WJ Stiekema). 

3.   Osbourn AE, Carter J, Papadopoulou K, Haralampidis K, Trojanowska M and Melton R. (2000) Oat root saponins and root-infecting fungi. In: Saponins in Food, Feedstuffs and Medicinal Plants, Proceedings of the Phytochemical Society of Europe, 45, pp:121-128  (Eds. W Oleszek and A Marston). Kluwer Academic Publ., Dordrecht.

4.   Haralampidis K, Bryan G, Qi X, Papadopoulou K, Bakht S, Melton R and A Osbourn (2001) A new class of oxidosqualene cyclases directs synthesis of antimicrobial phytoprotectants in monocots. PNAS 98: 13431-13436

5.   I Iturbe-Ormaetxe, K Haralampidis, K Papadopoulou AE Osbourn (2003) Molecular cloning and characterization of triterpene synthases from the model legume species Medicago truncatula and Lotus japonicus. Plant Molecular Biology 51: 731-743.

6.   Mylona POwatworakit A, Papadopoulou K, Jenner H, Qin B, Findlay K, Hill L, Qi X, Bakht S, Melton S, Osbourn A. (2008) Sad3 and Sad4 are required for avenacin A-1 biosynthesis and root development in oat. Plant Cell 20:210-212

7.   Omirou, M., Papastylianou, I., Iori, R., Papastephanou C., Papadopoulou, K.K., Ehaliotis, C., Karpouzas, D.G., (2009) Microwave-assisted extraction of glucosinolates from Eruca sativa seeds and soil: Comparison with existing methods. Phytochemical Analysis 20: 214-220.

8.   Omirou MD., Papadopoulou K.K., Papastylianou I., Constantinou M., Karpouzas D.G.,  Passam H., Ehaliotis C., (2009) Impact of nitrogen and sulfur fertilization on the composition of glucosinolates in relation to sulfur assimilation in different plant organs of broccoli. Journal of Agricultural and Food Chemistry 57: 9408–9417

9.   Delis C, Krokida A, Georgiou S, Peña-Rodríguez LM, Kavroulakis N, Ioannou E, Roussis V, Osbourn AE, Papadopoulou KK (2010)Role of lupeol synthase in Lotus japonicus nodule formation, New Phytologist (in press)

Σχετικά με το δικτυακό τόπο:
-------------------------------------------------
Υπεύθυνοι Ιστοσελίδας: Καθ. Δ. Λεωνίδας & Eπ. Καθ. Γρ. Αμούτζιας
Επιμέλεια: Αναστασία Παπαδοπούλου - Διοικητική Υπάλληλος Π.Θ.

Ανάπτυξη - Επέκταση: itbiz
Τελευταία επέκταση: Σεπτέβριος 2010

Στατιστικα

Μέλη : 3
Περιεχόμενο : 277
Σύνδεσμοι : 71
Εμφανίσεις Περιεχομένου : 2304819
Έχουμε 332 επισκέπτες συνδεδεμένους

Εικονες

ad4.jpg
  • Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
  • Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
  • Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας
escort ankara porno izle sikiş ukash